1986年3月中山医科大学附属第一医院派出以梅骅教授为首的医疗专家团队，建立了中山医科大学深圳医疗中心。1997年升级为中山医科大学深圳泌尿外科医院。同年由“中国试管婴儿之父”、中山医科大学庄广伦教授亲手创建了深圳首家试管婴儿中心。2003年医院更名为深圳中山泌尿外科医院。

2009年在深圳市政府支持下，医院由罗湖搬迁至福田中心区，面积、床位、设备均得到较大的提升。医院现有医务人员200余人，中高级职称78人，硕博士49人，人才梯队合理，技术、科研力量雄厚。

目前医院以生殖医学为重点发展方向，生殖医学中心是中华医学会生殖医学分会常委单位、广东省医学会生殖医学分会副主委单位。生殖医学中心试管婴儿成功率保持国内先进水平，生殖免疫诊疗中心复发性流产及反复胚胎种植失败诊治率处于国际领先水平。

 建院30多年来，医院在生殖医学、泌尿外科领域取得了丰硕的成果。医院获得了省、市级的重点学科、重点实验室、工程中心及博士后创新实践基地。近年来医院荣获国家、省、市科技进步奖5项。连续 3年获得卫生系统社会公众满意度排名前三。医院连续十余年被评为深圳市医保信用等级AAA单位。

医院宗旨：缔造健康生命，圆您美满家庭。